第二波的流感却与第一波不同，这一波流感传染性非常强，其死亡率也比普通流感高了近五十倍，尤其在二十至三十五岁的青壮年族群中死亡率特别高，其症状除了高烧、头痛之外，还有脸色发青和咳血等，许多人早上还正常上班，中午染病，晚上便死亡了。
面对突然爆发的灾难，各国政府这才开始努力隔离病患，对所有公共场合进行消毒，几乎所有国家都宣布限制公民进入公共场所，包括电影院、舞厅、体育馆等场所一律被关闭。
所有人都要尽量呆在家中，避免交叉感染，但是他们也仅限于隔离和预防，由于没有特效药，整个望乡星的医疗水平又不高，各国都没有什么好的办法消除这些可怕的流感病毒。
在所有国家之中，中华帝国开始预防最早，其方法也最为彻底。方啸宇有在前世非典中的经验，做出了非常多的规定。
第一，号召全国开始了卫生大清理活动，消除卫生死角，较少疾病的传播途径。第二，中华财团下属的各化工厂大量生产次氯酸和过氧乙酸，定期分发到各地政府，由各地清洁队对所有公共场所定期进行消毒。第三，除了要求居民尽量待在家中以外，还要求他们尽量带上口罩，并尽量避免吃生食，水也要煮开五分钟后才能饮用。
除了这些规定方啸宇早在第一次流感出现之后，就从受感染的士兵中间采集了病理植株，交给医学院研究特效药，甚至小风也将病理植株扫描进芯片，在模拟环境下进行对比和研究。但是任何一种药品的研制，都需要长时间的研究和临床验证，不是一两年可以搞出来了。
909年5月，第二波流感开始大爆发以后的两个月，中华帝国境内终于也出现了病例，就连马达加斯加岛上的中华军士兵中的病例，也开始出现显著增加，甚至出现死亡。
对于这些病例方啸宇非常重视，他立刻要求卫生部长孙小眉专门开辟医院安置这些病患并进行免费治疗。孙小眉也很重视，亲自带人给这些人制定治疗方案，结果在治疗中，孙小眉意外的发现中华帝国特产的青霉素和磺胺类药物对这种流感有抑制作用，虽然无法完全治愈，但能很快减轻症状。
中华帝国很快将这一成果向全世界公布出来，同时中华帝国各大制药厂开始加班加点生产药品，第一批药品除了供给国内使用之外，方啸宇开始平价向东协的各盟国供应，让各国的国内民众看到了治愈的希望，当地局势很快稳定下来。此外方啸宇也开始在各盟国推行中华帝国的各种防范经验，使得这些国家的病情得到了有效控制，死亡人数直线下降。
见到东协各国的病情得到了有效缓解，雅曼帝国等各个国家立刻向中华帝国提出了购买药品的要求。对于这些国家的要求，方啸宇是不会坐视不理的，他宣布对各国药品的需求，中华帝国敞开供应，不论是磺胺、青霉素，还是用于消毒的次氯酸和过氧乙酸都在供应之列。中华帝国毫不藏私的行为让各国为之欣喜，中华帝国在各国民众中的形象，一时间高大了起来。
中华财团虽然稍微压低了各种药品的价格，但还是赚的盆满钵满，不过方啸宇并没有因为药品赚钱而欣喜，他最焦急的是在马达加斯加岛上的十万中华军士兵，为此方啸宇再次进入芯片和小风商量特效药研制的问题。
“小风，为什么特效药如此难以研制。”方啸宇的意念进入了小风的控制大厅。
小风显出了实体回答道：“主人，这是很正常的情况，任何一种特效药的研制都是非常复杂的过程，何况这个世界的医疗水平很低，研制速度也慢。”
方啸宇点点头：“的确，我也是忽视了医疗方面，我还认为在这样没有抗生素的时代，有了青霉素就可以在很长时间之内高枕无忧了，就连中药方面也没有着紧。”
小风道：“一种药是不能包治百病的，这非常正常。主人也不必自责，其实我一直在进行生物医药方面的研究，对于中草药和抗生素方面研究的的确不多。”
方啸宇道：“现在我最担心的，就是马达加斯加岛的陆军士兵，不知道有没有什么方法，可以让我不会受到感染。”
小风道：“你怎么会有这种想法？”
方啸宇道：“我想到马达加斯加岛去，看望那些士兵，为他们提振士气。”
小风道：“你的身体经过了芯片的改造，已经部分具备了后世地球人的强悍体格，对于这种低级传染病本来就是完全免疫的。”
“啊？那你不早说。”方啸宇道：“我先去马达加斯加岛了，你可要抓紧时间研制特效药啊。”说完他就离开了芯片空间。
小风自语道：“要不是为了研究那些特殊药剂，怎么会耽误这么长时间，看来我也要关注一下这种低级传染病的特效药研制了。”
6月初，方啸宇不顾众多官员的劝告，毅然决定乘船到马达加斯加岛，看望在那里住了大半年的远征军士兵。得到这一消息举世震动，人们纷纷猜测这位全世界最有权势的皇帝陛下，到底是在岛的周围绕上一圈作秀，还是真的会去看望士兵。结果方啸宇的行动让世人大为吃惊，他居然在马达加斯加岛近海，将所有护卫留在了船上，独自一人换乘冲锋舟登上了马达加斯加岛。
方啸宇的这一做法不但让担任护航舰队指挥官的万勇中将吓了一跳，也让在马达加斯加岛上驻守的陆军官兵们吓了一跳，当他们得知方啸宇单人独舟来到了岛上时，众多官兵立刻前往迎接。
此时远征军的总司令，前国防军第十二军的军长肖成第一个走到了方啸宇身边激动的道：“陛下，你怎么能轻易犯险，到这种地方来。”