在上一回话中，快斗在生命即将绝迹之时，被神秘人救助并带走了他。
而另一方面，将德鲁贝和梅拉古的力量吸收，使威胁性的力量到了贝库塔手中。他的下个目标，就是失去梅拉古他们后怒火中烧的纳修！纳修二话不说就接受了与贝库塔的决斗，却被贝库塔的卑鄙策略马上逼到不利的状况……。那时，至今未被解明的他们自己的真正记忆开始复苏！
与纳修的因缘决斗的进行中，贝库塔得知了藏在自己身上的真实记忆。以贝库塔为首，巴利安七皇的记忆都受到上千主上操纵过。贝库塔把敌意转向那个改变自己命运的万恶根源上千主上，他开口对纳修说了出乎意料的话！
贝库塔用卑劣的战略折磨纳修。纳修的愤怒达到了颤抖的地步，他使出猛烈的攻击把贝库塔逼入绝境！这么一干之后，本该消灭了的上千主上的力量却再次复活，从贝库塔的身体完全独立出来……。一切都是依照上千主上的阴谋，他变成自由之身打算把贝库塔甚至游马也吸收掉。那时，与快斗展开激斗了的米扎艾尔出现！
巴利安之神上千主上为了得到‘源数代码’，打算要吸收巴利安的领袖·纳修。游马为阻止这个危机，与纳修一起对抗上千主上！
上千主上用场地魔法‘源数网络’来对游马他们穷追猛打，甚至召唤出攻击力10000的惊异怪兽‘梦幻虚神纽美罗尼厄斯’，打算把全世界收入手中！游马和astral变成异热同心并反复地进行拼命的攻防！
上千主上在临死前，将全部力量给予纳修，纳修将游马一行人带到星光界和异晶人世界的交接口，并告诉游马，自己是上千主上真正的诅咒。
上千主上没有篡改纳修的记忆，而是纳修自己来到了异晶人世界，纳修背负着异晶人世界的命运，向游马发出最终决斗。
游马和纳修都召唤出了新的王牌，在几个回合后，游马原来可以赢，却想到了自己梦里那扇门说的会失去重要的东西，游马解除了zexal，结束了回合，下回合纳修因七皇的荣光的代价lp变为0消逝了。
画上与纳修激斗的终止符后，巴利安世界被囚的无数灵魂降落到地上，拼上性命想守护这世界未来的同伴们和游马实现了喜悦的重逢，可是，全部“no.”到手后的astral终于使‘源数代码’出现，状况突然有了转变！astral为了完成托付的使命，挑起了与游马的最后决斗——战斗之仪。
拿到全部“no.卡”的astral一口气召唤了5只“霍普”毫不留情地向游马显示着那股力量！游马虽被那凶猛来势所压，却并不害怕，反而以全心全力享受与astral的决斗。那样的俩人的决斗，其实还隐藏着某个存在于游马和astral之间的重大条件！
就算被最凶恶的敌人逼向危机状况，游马也总是跟astral合力去赢得胜利。从许许多多的战斗之中，重复着与同伴的相遇和离别等种种经验，游马作为决斗者完成了巨大的成长，全力以赴与搭档·astral进行激烈冲突！
另一方面，astral把对游马的心意倾注在某个策略上。被坚固的羁绊所联结的俩人展开了你来我往的最后决斗！
最终游马创造出属于自己的fno.0 未来皇霍普取胜，修改了源数代码，七皇全部复活。就在这时浮在空中的源数代码突然发生了变化，从源数代码里飞出来一张卡片，那是‘no.100 源数龙’的卡片。
就在所有人都被眼前这一突发现象吸引注意力之时，从旁突然出现了一个披着黑斗篷的神秘人，他出手拿走了‘no.100 源数龙’。
“你是谁！为什么要拿走‘no.100 源数龙’！”
“他是月球上救走快斗的人！”米扎艾尔认出来眼前的这个披着黑斗篷的神秘人就是在月球上出现救走快斗之人。
“‘源数代码’已完成了它的使命，而作为着其中最为关键源数龙将被我带走，直到下一次真正会需要到‘源数代码’时，源数龙才会再次出现。
还有这个人还给你们。”
话音刚落，快斗突然之间出现在众人的面前。
“快斗！”
就在其他人的注意力被出现的快斗吸引围上去时，只有iv站在众人身后他直盯盯看着那个神秘人。
“那么再见。”神秘人一转身就消失。
看在神秘人消失之后，iv感到失落感，他总觉得那个神秘人给他有一种很熟悉和亲切的感觉，就宛如是……
直到之后他收到了一封信，证实了他的想法……