而各司主事者的人选安排，过去有的，还是基本保留原来的人选，只是做出一个改变，就是过去主管财务的是叶瑶瑱，管审计的是孙和京，现在将两人互调过来。而其他新增设的各司主事，经过商毅和叶瑶瑱、周世奇、唐镇等人的仔细商议，也都一一做了决定。
最终民政部六司主事的人选为：民政司主事为周世奇；财政司为孙和京；教育司主事陈义文，他原是临朐县的教愉，出任教育司主事到正合适；仲栽司主事为王仲平，过去是沂水司的巡检，和商毅有过几面之识；农田司主事孙成，他过去是沂水县的县丞，也和商毅等人都相识；工建司主事鲁石，他是从过去军器工坊中分离出来。
第二卷 落日篇 第四章 设立幕府（下）
而文书司，审计司这两个直接由商毅管理的部门主事，都由叶瑶瑱来出任。
其实按商毅本事的想法，叶瑶瑱应该是只管文书这一块，因为商毅考虑到自己未来有可能会长期征战在外，真正能管理行政的时间不会很多，家里必需要留一个自己信得过的人坐镇才行，周世奇的能力虽然不错，但一来年岁大了些，二来他的家族在自己的集团中占了很大一块，难保不会行些私弊的事情，必须对他的权力有一些制衡才行。
叶瑶瑱本身就俱被很强的亲和力，而且在这次北京之行中，商毅发现叶瑶瑱其实也有很出色的组织才能，加上她又是自己的正房妻子，当然是最合适的人选。但是在目前来说，商毅手下精通算术的人材不多，而审计司同样也是一个相当重要的部门，一直还找不到合适的人选，而叶瑶瑱以前做过财政，对审议的一套也比较了解，因此只能由叶瑶瑱来兼任。这样一来，以后自己出征在外，家里有叶瑶瑱和周世奇共同处理，应该可以让自己放心的。
整个民政系统就这样确定下来，而在统战部方面，参议司主事是唐镇，其实目前来说，这个部门的主要任务还是训练士兵，战斗计划基本是由商毅来制定，因此唐镇是最适合这个位置的人，因为虽然后来的战斗他基本都没有参加，但后期加入穆陵军的士兵基本都是由他来督促训练的。
军情司主事是周琦，他本身就是侦察营的营长，而商毅集团目前的情报工作，还是以临阵打探敌情为主，碟报，暗哨，长期潜伏的人员暂时还没有，因此这个职位自然非他莫属了；军器司主事仍然是孙和鼎，这一点没有变化；只有后勤司这个位置一时还找不到合适的人选，只能先让孙和斗来担任。
这下各部门的主事人员都确定下来之后，商毅命令各部门下面的分支结构的安排和工作人员都有各主事人员自行设定和委任，并在十天之后由各位主事将本机构工作人员名单和工作计划都交给商毅来确定。同时商毅对各司的工作责任要求，规章制度都做出了比较详细的规定。
整个行政系统建立起来之后，商毅也十分满意，如果试行一段时间，能够不出大问题，那么估计用这样一套班子，可以稳定的保持相当长的一段时间了，就算是自己以后能够建立一块新的根据地，也是基本上也都足用了。
行政机构完善下来之后，商毅也立刻开始建全军队的建制，这也是为出兵南下作准备。
目前穆陵军的整编工作以经基本完成，五个团和两个独立营的人员以经全部到位，接下来是各团营的武器装配、作装行动统一标准和纟统训练，以及后勤保障方面的事情。
商毅首先确定，对军队正式定名为商家军。对这个名字，军中的诸将都没有反对意见，因为在明朝本来就出现过一支以主将姓氏命名的军队——戚家军，有这个先例在，别人也说不出什么来。而且这支军队也确实是商毅一手创建起来的，商毅不仅是这支军队的最高指挥官，同时也是全军的精神支柱，可以说一但商毅不在了，这支军队就会立刻瓦解。
按照商毅的想法，第一团将留守在穆陵关，以第二团和第三团，骑兵营和两个侦察连为主力，出兵南下，第五团为预备队，第四团付责运送粮草物资。这一点相当重要，因为打仗从一定程度上说，就是拼后勤，尽管按明朝的规定，军队所到的地方，都由当地提供粮草，但商毅现在可不敢相信明朝各地的官员，另外穆陵军是以火器为主的军队，对后勤的依赖相当大，就算地方上能提供粮草，也不可能供应弹药，因此还是自立更生为好。
按照商毅制定的标准，毎个团应该配备的主要火器是一千八百多支火枪和二十门火炮。
而商家军原来有火枪两千多支，这段时间以来，又修复和制造了一部份火枪，而且商毅从北京又拉回来了大量的火枪火炮，因此目前全军共有各种火枪五千五百多支，俱体为：燧发枪加上改装的共八百余支，鲁密铳一千二百余支，鸟铳三千二百余支，自行生产的火枪三百余支。迅雷铳四十八支。火炮六十六门，其中有两千斤红夷大炮六门，一千斤红夷大炮六门，一号佛朗机炮八门，二号佛朗机炮十六门，三号佛朗机炮八门，四号佛朗机炮六门，虎蹲炮十六门。
按现在的火炮、火枪数量，缺口还很大，仅仅只能够装配三个团。对此商毅决定，将第二团和第三团按标准配置装配，毎个团装配两千斤红夷大炮二门，一千斤红夷大炮二门，一号佛朗机炮三门，二号佛朗机炮四门，三号佛朗机炮三门，虎蹲炮六门。一千八百九十二支火枪。
而第四团和第五团因为是预备军和运输部队，因此不用装配比较沉重的红夷大炮和一号佛朗机炮，只配备较轻的二号佛朗机炮四门，四号佛朗机炮三门，虎蹲炮二门。另有只装一个营即八百四十二支火枪。只有第一团暂时不装配任何火器。
武器的分配就这样决定下来。但由于火枪一下子增加了一倍多，虽然商家军一直保留着一部份预备火枪兵，但依然出现了大量缺额，必须训练新的火枪兵。同时商家军还增加了十二门红夷大炮，这可是商家军以前从未使用过的大炮，因此炮手们必需尽快熟悉红夷大炮的使用性能才行。
训练大体分为两类，新火枪兵仍然从基本的火枪射击和三段连射开始练习，而老火枪兵则开始进行突击、冲锋、包抄、与火炮、骑兵、长枪兵协同作战等练习。
虽然在此之前，商家军和清军作战中取得了很大的战果，但基本的作战方式都是先守住城池，在守城战中消耗敌军的兵力和士气，然而寻找机会，给敌军发动致命一击。即使是有小规模的野战，也是先排好阵式，等敌军攻上来，本质上和守城没什么两样。完全属于防守反击型的战术。
当然在面对强敌的时候，防守反击确实是一种合理而有郊的战术，但商毅考虑到，这一次南下，面对的可不是战斗力出众的清军，而是相对实力差得多的农民军，因此在南下以后的战斗，不会全是守城战了，野战，白刃战、攻坚战、遭遇战都会遇到，对商家军来说，将会是一次转型之战。那么在现在就要本着以实战为目标的原则，进行有针对性的训练中。
因此在训练中商毅一方面着重增加了拼刺刀的白刃战训练，另一方面也重点加强在遭遇战时，通过挖战壕，利用布袋盛土等方式，快速建立简易阵地的训练。对于以火枪为主要战斗武器的商家军来说，熟悉战壕作战技术，也是由为重要的。
同时还要考虑到南方的炎热、和多雨的气候特点，商毅也加强了士兵在高温情况下行军作战，在大雨中行军作战的训练。现在以经是五月中旬，基本以经进入全年最热的时候，虽然是在小冰河时期，这一段时间的气温依然会达到三十度以上，由其是在正午的时候，太阳也非常毒辣，但却成为商家军雷打不动的固定训练时间，而只要是遇到下雨的天气，都是商家军的重点训练的日子。
不过现在军队训练的俱体事情以经不用商毅再操心了，因为商家军里以经有了一批合格的中层指挥官，商毅只需做好训练计划，然后交给其他各团的团长、独立营营长，由他们根据自已的计划，自行安排每天的训练项目就行了。而唐镇的工作是付责组织和协调大规模模拟实力训练和各兵种的协调配合作战训练。商毅只是不定期的进行抽查和检验。
不过商毅打算在自己出发之前，写好一本《步军操典》的手册，交给留守的唐镇，以后对士兵的训练，就全部按照《步军操典》的要求来，也就不用商毅时时刻刻盯着了。
同时，商毅还给全军设计制定了统一的服装和军旗。
其实各代的军队都有自已的军服和军旗，明朝的军服除盔甲之外，一般都是鸳鸯战袄。而军旗除了主将的姓氏之外，一般都会使用猛兽的图案标志。
不过商家军从来就没有穿过鸳鸯战袄，一方面是来不及制做，另一方面也是商毅不想将鸳鸯战袄作为自己军队的统一服装。全部采用绿色棉布制作，对襟、短挂、窄袖，带肩章，小腿用白布打绑腿，穿多耳麻鞋的军服，并加上一顶八愣带沿的军帽，正中还镶着一颗五角红星。完全就是仿造后世共和国军队的野战军服。而军旗也是釆用五角星为主图案，再铺以其他的猛兽图案标志。
其实军服和军旗是什么形式，这本身并没有什么太多的意义，反正把盔甲一套，就全都遮住了，而且商家军的将领和士兵大都是农民出身，也没穿过鸳鸯战袄，因此众将看了商毅设计的军服和军旗样版时，都没有什么异议，相反对红五角星标志觉得十分新鲜。
其实将商家军的军服和军旗设计成这种样式，这完全都是出于商毅的怀旧情节，谁让他是特种兵出身呢？对于绿军服、红五星有着一种特殊感情，在估计不大可能回到自己原来那个时空的情况下，只能以这种方式来记念自己以前的生活。
第二卷 落日篇 第五章 受勋
“跨——跨——跨——跨——”
一队穿着灰绿色服装的士兵，头戴着镶红五角星的八角带沿的帽子，打着白布裹腿，肩扛着火枪，排列着整齐的方阵，迈着整齐的步子从主席台前走过。如果是不知情的人，还会以为是又看到了十九世纪三十年代的井冈山时代的红军。
而商毅坐在主席台的中央位置，对自己设计出来的军服十分满，这才是自己心目中的军队样子。
今天是商毅回到穆陵关后的第六天，也是商家军为济南战役的有功士兵举行受勋典礼的日子。为了这个典礼，商毅专程让穆陵关里的妇女们赶制了一百二十件新式的军服、军帽和一面新的军旗。军服、军帽都是用棉布做的，红五星是木质，涂上红漆。唯一令商毅感到遗憾的是，青州府买不到纯绿色的绵布，只能用灰绿色的来代替，而且以这个时代的染色技术，估计洗几次之后，就会发灰发白了。
其实对济南战役中的有功士兵的奖励，早就发下去了，这一次只是纯粹对有功的士兵颁发纪念勋章，一方面是增强士兵的荣誉感和凝聚力，另一方面也是为即将进行的南下战斗做一次战前动员。
对有功的士兵发纪念勋章，这一直都是商毅的愿望，只是以前各方面的条许不允许，才一直没有施行，但打下济南之后，金银的贵重金属极大丰富，终于可以按照商毅的意愿来实现了，在商毅离开穆陵关去北京之前，就给铁匠司下达了制做纪念勋章的任务，现在以经全部完工了。
全军的士兵除去少数站岗，巡哨之外，全部都在穆陵关的大操场上聚集。以各团营也单位，分成五个大方阵和两个小方阵席地而坐。而商毅等穆陵关的主要行政官员和军队的首脑人物都在主席台上就坐，而集团的其他所有官员幕僚，几位西洋的传教士，包括叶瑶瑱和尚未正式嫁入商家的陈圆圆都出席了这场典礼，在主席台两侧的贵宾台上就坐。
而在受勋典礼开始时，首先将举行一个升旗仪式。这也是制做新军服、军帽的目地。
整个升旗仪式自然完全是按后世升国旗的形式来进行，首先由军旗护卫队入场，在最前方左右两行各有八名扛枪士兵，中间是三名升旗手，在他们后面是一百二十护卫队士兵，从操场的中间一直走到主席台前的旗杆处。三名升旗手负责升旗，护卫队的士兵执枪行礼。虽然现在没法演奏国歌，但这到难不了商毅，由全军一齐合唱改编之后的《游击队之歌》为升旗伴奏。
对于这个时代的人来说，受勋或许都还见过或都听说过，但升旗仪式却是头一遭遇见，都觉得又新鲜又有趣，认为商毅总能想出一些稀奇古怪的花样来。
等升旗结来之后，接下来才是进入正题，给立功的士兵发放记念勋章。
在这次济南的战斗中，立功的士兵一共有三千多人，其中三等功有二千八百七十四人，二等功有五百二十七人，一等功有八十七人，特等功有三十六人。这也是商家军中首次出现特等功的士兵，立特等功的，都是当时为了攻取济南府，潜入城中，发动百姓暴动的侦察队士兵。
三等功的士兵发放铜制勋章，二等功的士兵发放银制勋章，一等功的士兵发放金制勋章，所有勋章的样式都相同，呈圆形，直径约为两寸，厚约二毫米，正面刻着战役的时间和名称，背面刻着士兵的姓名和功劳等级。而特等功也发金制勋章，但比另三种大一圈，其他的都一样。
因为立三等的士兵太多，不可能把每个人都叫到主席台上去领勋章，只能由各团长、营长上台代领，然后回去分发给每一个士兵。而等各团长、营长将勋章领回到自己的方阵后，知道自己有勋章的士兵纷纷向团长、营长索要，拿到勋章之后，都小心翼翼的摸了又摸，看了又看。周围为立刻凑过来好几个人，纷纷都要借着观看，气氛开始热烈了起来。
二等功的士兵都有资格上台去领奖了，还是以团营为单位，轮流上台领取自己的勋章，而在台下的士兵也都在为他们鼓掌欢迎。而领到勋章回到自己方阵的士兵，都会受到自己团营的同伴们的热烈欢呼。
而一等功的士兵是全面一起上台来领勋章，因为一等功的勋章是用金制，每一个人拿到之后，还要放在嘴里咬一咬，仿佛是确认一下，而同时台下的欢呼声也更响亮，全军都在为他们喝釆欢呼。拿到勋章的士兵也都扬眉吐气，一个个都昂首挺胸，一脸洋洋得的样子下台。
最后上台的是领取特等功勋章的士兵，这一次是由商毅亲自为他们发勋章，并且是给他们带在胸前。每发一个，还会拍拍每一个人的肩头，然而说几句鼓励的话，把后世国家领导人的样子学了个十足。而受勋的士兵们事先经过练习，带好勋章之后，立刻会前两步，对台下的士兵们行礼致敬，但每一个人都会得到最为热烈的回应。因为谁都知道这才是最高的荣誉，全场的气氛也达到了最高的顶点。
台下的士兵们见了，也都十分羡慕，没有得到勋章的士兵都暗暗下定决心，要在以后的战斗中出色表现，争取下一次自己也能领到一枚。而拿到了勋章的，也都不满足，还想拿到更高荣誊的勋章，因此在无形之中，旨一个人对荣誉的渴望呈度都大大加强了。
等台下稍稍安静下来之后，商毅才发言道：“战士们，刚才我们为每一位立下战功的士兵发放了勋章，表章他们在战场上的努力表现。他们都是我们的战斗英雄，值得我们毎一位战士尊重和学习。但是还有一批战士，他们也立过功，也为我们的胜利做出过自己供献，然而他们都光荣的战死在战场上，今天却没有办法上台来领取他们的应得的奖励。但我们永远都不会忘记他们。下面请他们的家属上台。”
谁也没有想到，今天的受勋大会上还有这么一出，立刻引得众人一阵喧哗，而在众人的议论声中，几十名男女老幼纷纷登上主席台。都是在这次济南战役中战死士兵的家属。当然不会是全部，仅仅只是部份代表。
由商毅亲自给每一户家属颁发了一面铜牌，约为一尺长，四寸宽，在正面刻有“光荣军烈家属”六个字，背面是战死士兵的名字，父母、妻子、儿女的姓名。商毅将铜牌一一发放每一户人家手里，然后所有的家属集中起来，郑重道：“你们的亲人是为了我们大伙而牺牲的，我们永远不会忘记他们，这面牌子你们都要好好的保管下去，让他们的子子孙孙，后代百世都知道，他们先人的光辉事迹，是一个伟大的英雄。”
随后商毅又下令，全军起立，向台上的家属行军礼致敬。
家属们一个个都感动哭了起来，有一个老头把铜牌高举过头顶，哭看道：“儿啊！你看到了吗？这就是将军发给咱家的勋牌，你可没有白死啊！我们大伙儿，子子孙孙，后代百世都会记得你的。”
他这一番话在这个时候有极大的感染力，台上台下立刻响起了一片哭声，也大大超过了商毅的预期效果。
虽然在这个时代，重恤战死士兵的家属，到是常有的事情，由其是在王朝较为鼎盛发达，财政较为宽松的时期，对士兵家属的怃恤也还很不错，但在明末这个时候，朝廷基本上也就顾不上了。死了就白死，朝廷还少了负担，这也是明军战斗力不强的原因之一。而商家军能够有这样顽强的战斗力，商毅一直坚持对战死的士兵家属进行重恤，使士兵减少了许多后顾之忧，也是一个重要的原因。
而商毅不仅仅只限于对家属的怃恤，还要授于他们相当大的荣誉，从而也进一步激发了战士们对参军作战的热情，和战斗意志。
等军属下去之后，接着又上来五六十人，这些人一上台，马上又引起了抬下的一阵骚乱，因为这一次上台的都缺胳膊少腿，或者是有眼睛失明的战士。都是这次济南战斗中落得终身残疾的士兵。商毅同样也宣布，对他们享受军烈家属的待遇，并且也给每人颁发一枚战斗纪念勋章。
其实对士兵来说，战死到并不是最可怕的事情，最为可怕的是落得一个终身残疾，不死不活，那才是最杯具的结果。不过谁也没有想到，商毅会对这样的士兎也进行了表彰抚恤，自然也使台上台下的士兵们大受感动，由其是那些残疾的士兵，本来以为自已这一辈子以经完了，那知现在不但后半生有了保证，还有了无尚的光荣，因此有许多都落泪痛哭起来。
还有几个残疾的士兵甚致就在主席台上给商毅跪下，痛哭流涕道：“大人，虽然我们不能打仗了，但还能做别的事情，那怕是看门护院，做牛做马，只要是我们能做的，我们一定都会尽力去做，绝不能这么白吃白喝的过日子。”
商毅心里也暗自叹息，中国的农民确实是最仆实的一群人，只要你对他们一分好，马上就会得到成倍的回报。只可惜许多人都认识不到这一点。赶忙过去将他们扶了起来，道：“好，你们放心吧，只要你们愿意，我还有重要的事情交给你们去做。”
第二卷 落日篇 第六章 传教和教学
果然，给士兵们发放了勋章之后，全军的士气得到了极大的提高，对训练的积极性和热情，也都增加了不少，在训练之余，不小士兵都会自觉加量练习。
其实对战死士兵的家属，以及伤残士兵的厚恤，不仅仅是为了提高战士们的士气和解除了他们的后顾之忧，更为重要的是将全军的利益和商毅捆绑在一起，因为现在的商家军，完全是建立在商毅个人基础上的一支军队，一但商毅不在了，那么士兵所有的待遇，享受的福利条件也将都不存在了。因此想要维护自己的利益，首先就必须维护商毅在军队中的绝对领导权。
不过这样一来，另一个问题也摆在商毅的面前。
在第二天第一次招开的全体管理人员会议上，财务司的主事孙和京就向商毅提出了财政问题。当然并不是说目前穆陵关出现了财政危机，相反现在关城里的白银、粮食储备还是相当充足。但一个显而易见问题摆在了眼前，目前穆陵关没有任何可靠的收入。财政状况完全都是只出不进，时间长了，难免会坐吃山空。
而且现在穆陵关的各项建设也都需要花大量银钱，在商毅去了北京这不到一个月的时间里，就花费了二十多万两白银，二万多石米。其中大部份都是用来安置居民，也有一小部份是用来完成穆陵关里的建设。尽管重修城墙和扩建的计划以经搁置了下来，但以前制定的房屋、道路等基础建设还是要继续完成的，目前各项工程也都进行得差不多了。另外还有各工匠坊的建立，也都需要用钱。
同时商家军马上就要南下平乱，这也是需要花费大量钱粮的，居孙和京初步估计，需要十五到二十万两白银和五万石左右的粮食，因为现在军队里的武器缺口还是很大，因此与之相配套的铁匠坊，火药坊的生产规模也要扩大，但随之而来的，就是厂房设备、生产原料、工人工费都要跟着提高，孙和京估计这一块至少也要十到十五万两白银左右。而且随着战事的进行发展，还不知会增加多少新投入。
听完了孙和京的汇报之后，商毅也意识到，穆陵关的财政情况并不是像自己想象的那么轻松。虽然从清军那里抢来了天价的白银粮草，但自己的摊子也在急聚的扩大。而且使用火器作战，本事也是一件烧钱的事情。近代的战争基本就是拼财力，欧州的许多国家其实并不是打仗打输的，而且活生生被战争拖挎的。
但问题在于，商毅现在也没有任何增加收入的办法，从自己成军到现在，其实一直都没有能赚钱的办法，资金来源主要就是靠抢，先抢流寇匪贼，后来抢清军。但现在清军退了，而山东地方都只有一些小贼，抢他们也不过是杯水车薪，无关大局。
商毅也不是没有想过这个问题，想办法为自己开避一条财源，并且也考虑了其他穿越都的方法，像什么生产玻璃、肥皂、牙刷等超前的商品赚钱。但最终商毅杯具的发现，这些方法至少在现阶段都难以实现。且不说以目前自己的技术水平能不能生产出这些商品，就是生产出来，又卖给谁用，又需要卖出多少产量才能维持自己的开支。
一个玻璃杯卖一千两，一块肥皂卖一百两这些桥段只能是现代人的胡想，事实上一个玻璃杯能够买到五两银子就万事大吉了，而且还只是有钱的富户人家才会买，穷人压根就不会理，说白了，现在的中国依然是一个以小农经济为主的社会，一户人家就是一个小型的生产单位，自给自足的生产能力极强，绝大多数的农民一年之中跟本就买不了什么东西，什么都是自己家里做。
这时农田司主事孙成道：“将军，我看是不是可以像各军户征税，这样至少能保证一定的收入来源？”
商毅摇了摇头，道：“不可，一来我以经答应过军户，第一年不征税，因此决不能出尔反尔，二来刚刚经过大难，军户们也无多少积蓄，冒然征税只会使人心不稳，三来我们现在一共才不到三万户的人口，就算征税又能征到多少？因此征税之举，万万不可，这一点就不用再议了。”
其实商毅说的这些情况孙成也不是不知道，只是他本是县丞出身，一但遇到财政困难，首先想到的就是给百姓加税、分派这些老办法。但商毅显然不是这种做派。
商毅见众人都有些垂头丧气，也道：“各位，都不必这样沮丧啊，致少我们的财政维持半年是足够的，而在这半年时间里，说不定又会有别的解决办法呢？”
接着他又问叶瑶瑱道：“我记得我们库房里有许多金银玉器、珍珠，还有不少绸缎、缎衣、裘衣。”
叶瑶瑱也点点头，道：“不错，库房里现在有珍珠一千六百八十余两，还有各色绸缎共二万三千七百余匹，缎衣和裘衣四千二百余领。各种金银玉器一万三千六百三十余件。”
商毅笑道：“我看这些东西留着也是没有用，还占库房的位置，到不如把它们全都变买掉，换成白银和粮食，也就可以多支撑一段时间了？我看这些东西少说也值个一二十万两白银吧？”
周世奇也点了点头，道：“这到也是个办法，不过山东遭遇大难，我们又缺少销路，这些东西要全部变卖掉到也不易。”
商毅想到青州府的林家商铺的分记，看来可以找他们想想办法，道：“这个我来想办法吧，也不是要一时都卖了，可以慢慢卖掉。”
随后其他各人也都提出了一些本部门的问题，有些事情当时都解决了，有些还需要进一步的考虑和讨论。比如教育司主事陈义文提出，按商毅的教学要求，缺少教授西式数学的教师。
散会之后，商毅首先命人去青州府请林家商铺分记的掌柜林琛到穆陵关来。随后又叫人把阿科尼亚等四名天主教的传教士请来。
到达穆陵关之后，商毅拔给这伙洋和尚门一座房屋，暂时充当临别教堂，四个洋和尚和两个假洋和尚也十分满意，因为他们都从阿利尼亚那里得知了穆陵关的现状，不可能马上就给自己盖一座真正的教堂来，洋和尚们也本着有条件要上，没有条件那就自己创造条件，还是要上的原则，也就开始了传教的工作。
阿科尼亚在穆陵关住过一段时间，还是有一定的人脉基础，而且他也牢记汤若望的教导，不要急着扩大洗礼教徒人员，而是先尽量发展免费注册会员，扩大天主教的影响力再说。因此传教活动开展起来之后，也有一定的效果，毎天都会有些人到教堂来听几位洋和尚讲天主教的教义。
反正对于中国的百姓们来说，见庙就烧香总是没错的，管他是中国佛爷还是外国菩萨，礼多人不怪，神灵也不会怪吧。其实绝大多数中国百姓都不知道，自己过去拜的佛爷、菩萨都是外国的神灵。因此还有人像上帝的画像烧香，磕头。对此阿科尼亚深有认解，这是中国人的宗教习惯，也都不加以制止，相反还十分高兴，证眀有中国人开始接受天主教了。
而且商毅招开受勋大会时，几位传教士也十分荣兴的在观礼台上占得一席之地，这表示了商毅对天主教的重视态度。因此听到了商毅的招唤之后，几个人立刻赶到了将军府里来。
原来商毅是要给洋和尚本派活干了。耶稣会来华的传教士基本都有一技之长的，其中有许多人还是综合人材，像阿科尼亚善长医学和绘画，对数学也有一定的水准。
而这一次跟他来到穆陵关的三名传教士中，傅泛际善长开矿冶金，他原来在葡萄牙出生于一个矿工的家庭，父亲是一个葡萄牙的小矿主，而傅泛际本人也在矿上也干过五六年，有比较丰富的开矿实际经验，对阿格里科拉撰写《矿冶全书》也有深刻的研究。
而阳玛诺善长于机械制造，这个洋和尚本身是钟表匠出身，在锻造厂也干过，不仅能制做钟表，而且对欧州的车床机械都有一些的研究、当然这两个人是汤若望应商毅要求，而特意选派出来的专业人员。而郭纳爵和阿科尼亚差不多，算是综合人材，医学、数学、物理、天文啥都懂一点。
对此商毅的分配是，阿科尼亚和郭纳爵在医院和学校干活，主要负责给关城里的居民看病，并且教授学生们欧州的科技知识。虽然目前暂时只教数学和几何，但按商毅的想法，以后还要逐渐增加物理、天文、医学等方面的课程。不过这些知识在欧州其实也是近百年才开始逐渐兴起，还很不成熟，因此商毅让洋和尚们先弄出一个基本的教学大纲来，以后再慢慢增加教学的科目。
第二卷 落日篇 第七章 医疗和开矿
同时阿科尼亚和郭纳爵还有另一个任务，就是在穆陵关里迅速建立起一个初步的医疗系统来。并且要陪养一批军医，参与这次南下的作战。
尽管在后世，医学界对中医理论有很大的争议，但在古代，以中医理论为基础的中国医学水平在很长一段时间里，要远远高于西方，由其是中医基础的经络和阴阳五行系统，也使中医形成了相当成就的理论，并且在很早的时候，就出现了专职的医生和专业的治疗程续。而在西方十五世纪以前，医疗基本都是由教会来兼职，绝大多数治疗手段都是祷告和念经。
但到了十六世纪之后，西方的医学有了长足的进步，缩短了与中国的差距，在1543年，尼德兰人萨留斯完成了《论人体的构结》一书，同时期的西班牙人塞尔维特发现了心肺之间的血液小循环，使欧州医学开始朝着人体研究和血液循环理论的方向迈进，到了1628年，英国人哈维写成了《心血运动论》一书，系统的阐明了血液循环理论，从而开避了生理学和医学的新时代。
尽管在差不多同一时期，中国的李时珍也写出了一部伟大的医学著作《本草纲目》，但本质依然还是秉承的传统医学，没有能够突破传统医学的极限，而欧州医学却以经突破了中世纪的限制，在逐步向近代、现代医学靠近。不过总体来说，在十七世纪中期时候，东西方的医学水平差不多还是在同一水平线上。
在古代，军队里的医疗技术水平很差，一方面是时代整体的医疗水平不高，另一方面也是因为高水平的医生者不愿从军。通过前几次与清军的战争，商毅就发现这个问题，伤病员的治愈率极低，一般只有百分之三十左右。而其实大多数士兵受得伤都不重，以这个时代的医学水平，只要有足够完善的医疗条件和受过专业训练的医疗人员，完全可以抢救许多士兵的生命。因为毎一个士兵都是经验丰富的老兵，能多救活一个，都是一笔宝贵的财产。
但现在商毅手下缺口最大的技术人员就是医生。因为越是在乱世，医生就越是吃香，由其是有能力有经验的大夫，到那里都能混得上好生活，不用像其他一般的百姓和工匠那样，非要在商毅的手底下才能混上饭吃。虽然目前商毅手底下到是有六十多个郎中，但绝大多数都是走街窜巷，卖什么大力丸、回春丹的蒙古大夫。真正有坐堂问诊水平的大夫，才只有两个人。但商毅目前急需要提高自己治下的医疗技术，因此暂时只能依靠传教士的力量。