结果就是一场悲剧，哭庙案被大清官方定性为一场意识形态斗争，他们认为这是清定鼎后江南士子不满其统治的表现。这一案一百多人被处死，凡是伐鼓聚众、撰写哭庙文、参与请愿示威活动的人员均遭到处斩，妻子家产籍没入官。仅仅写了篇哭庙文、甚至都没有到过现场的金圣叹被当作此案的主犯，阴差阳错地当了“异议分子”。
一百多士子不分老幼通通砍头，关外蛮族用血腥镇压的方式教训了痴呆愚笨的江南士子，让这些读书人明白了大明对读书人的优待，是何等的难能可贵。由此之后读书人对满清政府，便乖乖的装起孙子来了，也不见有半点气节。作为穿越众，马城深知对付这些痴呆读书人的办法，就是简单粗暴。
三百多士子在孔庙哭了三天，等不到朝廷的回应便暴躁起来，居然砸了国子监，打死了两个国子监东厂坐探，又将目标对准厂卫，聚集了数千人浩浩荡荡，往锦衣卫南镇抚司杀去。锦衣卫，如今是天下士子的眼中钉，东林诸公都是锦衣卫查办的，最可恨的锦衣卫动手将天下书院禁绝，身穿飞鱼服的朝廷鹰犬自是人人得而诛之。
京师中泼皮，无赖，一干长随簇拥着数百士子往南镇抚司而去，纠集了几千人倒也浩浩荡荡。
街边，摘星楼。
马城，李开元，卢象升端坐在三层楼上，满桌子精致的小菜却没人动过筷子，卢象升面色发青十分难看，不时在房中走来走去，祸事了，数百士子在孔庙闹了三天朝廷毫无反应，这是大明孝宗以来从未有过的诡异状况。一般来说士子闹事厂卫是不敢得罪的，朝廷多半会让步，如今朝廷突然不肯让步这些读书人便暴躁起来，连国子监都打砸了。
马城面色如常心中只是冷笑，闹事，闹的过坦克车么。
李开元也劝解道：“卢兄，楼板都要被你踩塌了。”
卢象升停下脚步断言道：“此事必有蹊跷！”
李开元只是半开玩笑道：“如何蹊跷，读书人闹事不是一向如此，读书人打死个把人有什么事，当年金鸾殿上可是连都指挥使都敢活活打死的。”
马城微笑不语，卢象升面子上也不好看，这一段公案也是大明之耻，当年土木堡之变平息后，郕王朱祁钰摄朝朝议时，右都御史陈镒上奏请求诛杀王振全族，并称：「振倾危宗社，请灭族以安人心。若不奉诏，群臣死不敢退。
其上奏同时痛哭，廷臣一时纷纷响应。朱祁钰无法做决定，于是下令择时改议，廷臣则抗议不依。朱祁钰一时恐惧，将站起离去，内使将关门，众臣随后拥入。朱祁钰只得下令籍没王振家，并遣锦衣卫指挥马顺前往。
众人称：“马顺是王振党羽，应当遣都御史陈镒。”
当时太监金英传旨，令百官退下。众人却欲殴打金英，金英脱身而入。
这时，都指挥使马顺站出叱斥百官，户科给事中王竑突然站起带头在朝廷上猛击马顺，并咬下其面，称马顺往往藉助王振的威严作恶，现在到此了，你还不知道恐惧么！於是众臣纷纷跟随，马顺当即毙命。众人又向郕王朱祁钰索要王振党羽毛贵、王长两人，金英於是将两人踢出，随即两人被群臣群殴致死。
将一个都指挥使活活在朝议时群殴致死，这便是大明读书人干出来的事情，后世还对此大加褒扬以为经典，简直荒谬。瞧瞧先动手的是谁，户部给事中，言官，清流呀，一言不合将国朝堂堂都指挥使，三品大员活生生打死了，真是暴躁的很。李开元拿出此事嘲讽，卢象升自是无言以对，但凡要点脸面的，都不会认为这是给读书人脸上贴金呢。
如今读书人又暴躁起来要打砸南镇抚司，李开元这些勋贵自是看不惯。
卢象升顾不上汗颜，央求道：“开城，此事你要管一管，真的要祸事了！”
马城无奈，沉声道：“你两人还不明白么，闹了三天，为何厂卫不动一兵一卒，真当厂卫都是软脚虾么。”
卢象升面色顿时苍白，被稍一提醒便意识到这是个大坑呀，就等着不开眼的蠢物往坑里跳呢。先前那两个在国子监被打死的厂卫坐探，没准就是人家抛出来的诱饵，这些蠢物想也不想便吞了下去。卢象升脸色越来越差，挖坑埋人是魏公公最拿手的伎俩，这背后还必然有皇上的影子。
皇上这还不满十八，就学会挖坑埋人了，还真不愧是神宗皇帝的骨血。
想明白了这一点，再往这坑里跳的便是蠢笨如猪，智商爆炸的人头猪脑，谁跳进坑里必死无疑。
李开元恍然大悟，又奚落道：“人头猪脑的蠢物也要干预朝政，这些蠢物知道衙门口是朝哪开的么。”
卢象升瘫坐在椅子上，马城心中暗爽，这话说的可是太对了，这种人头猪脑见坑就跳的蠢货就能代表正义，能代表国家么，那这个国家是有多蠢。这些蠢货已经断送了抚顺，断送了辽沈，再蠢下去便要连大明朝也要断送了，闹吧，你闹的过坦克车么。
两个时辰后消息传来，南镇抚司被士子们砸了，还点了把火烧起来了。这消息传不传也都罢了，南镇抚司方向火光冲天，浓烟将附近几条街都笼罩住了，卢象升脸色死灰心知厂卫要动手了，也忍不住大骂没脑子的蠢物，想那南镇抚司是什么凶险的地方，怎会让人轻易冲进去放火，这火是谁放的还说不准呢，如此呆萌蠢物活该被人砍杀。
沿街传来嘈杂的马蹄声，呵斥声，厂卫倾巢而出大肆搜捕凶犯。
大明律，聚众冲击衙门无论从犯，主犯皆斩，这回连南镇抚司都烧了，这几千人都罪无可赦。马城叹气皇上哪点都好，就是对在京师地面上聚众闹事有点心理阴影，这都是前年那场宫变惹出来的，偏偏这些萌物想不开偏要往刀口上送，又怨的了谁。
楼梯响动，几个东厂番子冲进摘星楼拿人，被马城亲兵拦下。
李开元在楼梯口现身，冷哼道：“滚！”
几个番子慌忙告罪滚走，卢象升却一脸木然自知上了贼船，经此一案，大明皇帝和天下士子之争越演越烈，矛盾已然无法调和。厂卫自然不能杀尽天下士子，读书人却不会束手等死，江南又要乱了。卢象升喝了个酩酊大醉被送去客房，外面现在是兵荒马乱，马李两人仍是对坐闲聊。