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伏羲统一东胜神州后，开始治治理起来人族，而伏羲每十年，便组织人，亲自前往万寿山下的圣城朝拜，表示对圣父的尊崇。
孟津东部有一条图河与黄河相接，龙马负图出于此河，伏羲氏依龙马之图画出了乾、兑、离、震、坎、艮、坤为内容的卦图，后人称为伏羲八卦图。
明极收回河图、洛书，回蓬莱岛复命去了。
伏羲氏仰观象于天，俯察法于地，用阴阳八卦来解释天地万物的演化规律和人伦秩序。伏羲氏取火种、正婚姻、教渔猎，结束了人们茹毛饮血的历史。龙马负图寺遂成为“河图之源”伏羲氏则被奉为中华民族的“人根之祖”、“人文之祖。”
在东胜神州的一处山中名为少典部落里，有一小孩，天生奇特，名为神农氏。
神农一生下来就是个“水晶肚”几乎是全透明的，五脏六腑全都能看得见，还能看得见吃进去的东西。
少典部落的族人对此也很奇怪，毕竟这种事情还是很稀奇的。
那时候，人们经常因乱吃东西而生病，甚至丧命。神农为此决心尝遍百草，能食用的放在身体左边的袋子里，介绍给别人吃，用作葯用；不能够食用的就放在身体的右边袋子里，提醒人们注意不可以食用。
但是光有此心不行，神农没有真个实力，所以神农四处巡山拜师，但却无一所成。
云中子这些年来一直关注着神农，神农与伏羲不痛，伏羲有前世，等到伏羲功成之时，就是恢复前世伏羲之日。那时候的大神伏羲，怎么可能是云中子的弟子。
但是神农可以，神农没有那么多道道，身世清白，所以神农可以做云中子的正式弟子。
神农这几年拜师的所作所为，云中子都一一看在眼里，终于在神农拜师未果后，云中子出现在了神农面前。
云中子，即使是穿着最普通的衣服，但是云中子的气质，依然就能让人一眼看出来，云中子就是一个得道仙人。
神农那着出现在自己身前的云中子跟往日里想要拜师的人一比，发现云中子才算是真正的有道仙人。急忙上前几步，来到云中子面前，作揖道：“神农见过仙长。”
云中子单手在前，也还了一礼，道：“有礼。”
看到云中子这么和蔼，神农追问道：“敢问仙长仙乡何处？”
云中子微微一笑，道：“贫道乃是明教弟子。”
明教，在人族就是一块金子招牌，神农又作了一揖，求道：“还请道长收我为徒。”
云中子问道：“你拜我为师，所为何事啊。”
神农一脸坚毅，道：“愿尝百草，造福苍生。”
云中子要的就是神农这种坚定不移的信念，道：“好，我便收你为徒。”
“神农，拜见老师。”神农大喜过望，行过拜师之礼后，恭恭敬敬的站在了云中子身前。
云中子又对神农道：“你既然拜我为师，自当知道我的来历，为师云中子，乃是明教二代弟子，你还有一师兄，名为伏羲。”
人族之首的伏羲，居然是自己的师兄，而自己的老师竟然还是圣父的亲传弟子，这让神农怎么不喜。
于是云中子留在了少典部落，悉心教导了神农三十载，还用明玄赐下的乾坤鼎为神农炼制了一鼎，名为神农鼎，一鞭，名为赭鞭。之后，云中子便飘然离去了。
而帝师云中子的大名，村中之人还是都知道的，所以，当云中子离开后，神农之父少典，便将族长之位传给了神农。
而神农得此机会，大展所学，将云中子所教的知识，一一用在了少典部落中，让原本落后的少典部落，迅速发展，不过十年，少典部落便成为了远近闻名的大部落。
一天，一只周身通红的鸟儿，衔着一棵五彩九穗谷，飞在天空，掠过神农氏的头顶时，九穗谷掉在地上，神农氏见了，拾起来埋在了土壤里，后来竟长成一片。他把谷穗在手里揉搓后放在嘴里，感到很好吃。于是他教人确倒树木，割掉野草，用斧头、锄头、耒耜等生产工具，开垦土地，种起了谷子。
神农氏从这里得到启发：谷子可年年种植，源源不断，若能有更多的草木之实选为人用，多多种植，大家的吃饭问题不就是解决了吗？那时，五谷和杂草长在一起，草葯和百花开在一起，哪些可以吃，哪些不可以吃，谁也分不清。神农氏就一样一样的尝，一样一样的试种，最后从中筛选出的稻、稷、麦、菽五谷，所以后人尊他为“五谷爷”、“农皇爷。”
而神农在少典部落的所作所为，得到云中子通知的伏羲也一直关注着，看到自己的师弟能有此成就，伏羲也感到由衷的高兴。
神农所筛选出来的五谷，实为造福人族之大事，于是伏羲召见了神农，商量推广之事。
师兄弟两人，虽然一直未曾见过，但是两人神交已久，所以两人谈的很尽兴，如何推广五谷之事，也被商量出来了。
做完这一切的神农，在重新回到少典部落后，神农就开始了当年拜师所立的志向，遍尝百草。
神农带着神农鼎，赭鞭，离开了少典部落，开始走访各地，险山恶水。
由于神农天生水晶肚，所以每次吃下的葯草有什么效果都能看到，能够准确的判断出葯草的用途。
赭鞭能辨别葯草是否有毒性，让神农避免了很多次意外。
历经百年后，神农再次回到了少典部落，闭关十年，写出了神农本草经一书，记载了神农百年中所尝过的葯草的用途。
又十年后，伏羲正式传位与神农，功成身退，成就天皇之位，恢复了前世的记忆。
明玄、老子‘娲、云中子四人来到伏羲部落，亲自为天皇伏羲加封。
伏羲斋戒沐浴后，一步一步走上了天坛，然后敬过天，礼过地。然后道出自己平生所做的事情，表明自己问心无愧。
当伏羲讲出自己所做之事后，天上降下一道功德金光，沐浴伏羲全身。而伏羲得功德金光之助，一道紫光闪过之后，伏羲恢复了前世的记忆，但是却未能成就圣位，也只不过是准圣后期，斩却善恶两尸的境界。
而云中子身为帝师，教导伏羲，也有一道小于伏羲的功德金光柱降下，融入自身。
然后老子正式册封了神农为人族的地皇，任命神农治理人族。